☆結論
直接色を変えるapiが無いのでrefreshイベント時にセルに色を付ける。
$( ".selector" ).on( "pqgridrefresh", function( event, ui ) { //JQueryとかでゴニョゴニョする } );
refreshなので多少表示がチラ付くけれど、これ以外だとpqgrid本体を改造でもしない限り無理そう。
☆補足
商用版のpqgrid proにはgrid tableのtrまたはtdへのクラス追加要素のpq_rowcls と pq_cellclsが用意されていてこちらの方が便利になっている。
こちらを利用して追加クラス名にcssで色指定を行えばチラ付く事も無い。